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Copyrights 2009 Computational Biomolecular Chemistry Laboratory
(1)アミノ酸間平均距離統計に基づく解析
Average Distance Map(ADM)法
残基間平均距離統計に基づく残基間ポテンシャルによるコンタクト
頻度の解析(F値解析と呼んでいる)。
具体的なテーマ
1.αβsplitタンパクのフォールディング機構の解析
2.グロビンフォールドE-Hユニットの普遍性
3.IgG結合タンパクにおける高配列相同性タンパクの構造に差異
4.α/βタンパクのフォールディング機構の解析
(2)Go モデルを用いたタンパクの構造形成機構の予測粗視化したタンパ
クモデルとGo モデルを用いてタンパクフォールディング機構の再現
を試みる。
(3)タンパクのフォールディング機構と進化との関係の解析