生物機能や生物資源（バイオマス）を利用した再生可能なエネルギーのことです。酵母と糖質を用いて作られるエタノールは、飲料だけでなく古くからエネルギーとして利用されてきました。バイオガスと呼ばれるメタンや水素もバイオマスから微生物により生産され、最近活発に研究されています。一方、化学反応により油脂の着火点を下げたバイオディーゼル燃料も開発されており、欧州を中心に実用化されています。